Около 70% всех ядерных испытаний бывшего СССР проведено на территории Казахстана с 1949 по 1989 годы. Большая часть из них, включая 116 воздушных и наземных взрывов, была проведена на Семипалатинском полигоне (СИП). Здесь испытывалась первая в СССР атомная (1949 г.) и первая в мире водородная (1955 г.) бомбы.
Изучение последствий поведения ядерных испытаний на территории Казахстана и предотвращение дальнейшего загрязнения окружающей среды находятся в ряду наиболее актуальных проблем, стоящих перед Республикой.
Одной из приоритетных задач в деятельности НЯЦ, определенных Правительством РК, является ликвидация последствий испытаний ядерного оружия на территории Казахстана.
За прошедшие 10 лет после закрытия полигона специалистами центра была налажена планомерная работа по ликвидации последствий испытания ядерного оружия на СИП:
Для решения задач радиационного мониторинга на бывшем испытательном ядерном полигоне "Лира" был организован Аксайский филиал.
На бывшем Азгирском ядерном полигоне в Западном Казахстане функционирует Азгирская радиоэкологическая экспедиция, которая выполняет работы по радиационному мониторингу территории.
Одним из существенных элементов улучшения радиационной обстановки на территории Казахстана является хранилище отработанных ампульных источников ионизирующего излучения "Байкал", созданное на базе реакторного комплекса "Байкал-1". В настоящее время это хранилище, являющееся единственным в Республике, принимает отработанные источники со всей территории Казахстана.